Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC19Q6DKK2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms