Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRAMEF6Q5VXH4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF6Q5VXH4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms