Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF220Q5VTB9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms