Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM164Q5U3C3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM164Q5U3C3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms