Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF58

IFFO2, Intermediate filament family orphan 2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO2Q5TF58 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFFO2Q5TF58 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFFO2Q5TF58 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFFO2Q5TF58 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFFO2Q5TF58 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
IFFO2Q5TF58 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
IFFO2Q5TF58 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFFO2Q5TF58 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
IFFO2Q5TF58 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
IFFO2Q5TF58 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFFO2Q5TF58 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFFO2Q5TF58 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFFO2Q5TF58 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFFO2Q5TF58 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFFO2Q5TF58 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFFO2Q5TF58 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFFO2Q5TF58 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFFO2Q5TF58 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFFO2Q5TF58 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
IFFO2Q5TF58 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFFO2Q5TF58 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFFO2Q5TF58 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
IFFO2Q5TF58 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFFO2Q5TF58 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFFO2Q5TF58 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFFO2Q5TF58 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFFO2Q5TF58 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms