Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC1Q5TB30 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms