Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CCDC18Q5T9S5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CCDC18Q5T9S5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CCDC18Q5T9S5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CCDC18Q5T9S5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CCDC18Q5T9S5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CCDC18Q5T9S5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CCDC18Q5T9S5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CCDC18Q5T9S5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CCDC18Q5T9S5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CCDC18Q5T9S5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CCDC18Q5T9S5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CCDC18Q5T9S5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC18Q5T9S5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC18Q5T9S5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC18Q5T9S5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC18Q5T9S5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC18Q5T9S5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC18Q5T9S5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC18Q5T9S5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC18Q5T9S5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CCDC18Q5T9S5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
CCDC18Q5T9S5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
CCDC18Q5T9S5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC18Q5T9S5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC18Q5T9S5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC18Q5T9S5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
CCDC18Q5T9S5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CCDC18Q5T9S5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
CCDC18Q5T9S5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CCDC18Q5T9S5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC18Q5T9S5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC18Q5T9S5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC18Q5T9S5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC18Q5T9S5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC18Q5T9S5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CCDC18Q5T9S5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC18Q5T9S5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC18Q5T9S5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC18Q5T9S5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CCDC18Q5T9S5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CCDC18Q5T9S5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CCDC18Q5T9S5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CCDC18Q5T9S5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC37.2■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC18Q5T9S5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
CCDC18Q5T9S5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms