Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LDLRAD1Q5T700 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LDLRAD1Q5T700 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms