Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIF1Q5T3J3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIF1Q5T3J3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIF1Q5T3J3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIF1Q5T3J3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIF1Q5T3J3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIF1Q5T3J3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIF1Q5T3J3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIF1Q5T3J3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIF1Q5T3J3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIF1Q5T3J3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIF1Q5T3J3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIF1Q5T3J3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIF1Q5T3J3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIF1Q5T3J3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIF1Q5T3J3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIF1Q5T3J3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIF1Q5T3J3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRIF1Q5T3J3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRIF1Q5T3J3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LRIF1Q5T3J3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIF1Q5T3J3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LRIF1Q5T3J3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRIF1Q5T3J3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRIF1Q5T3J3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIF1Q5T3J3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIF1Q5T3J3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIF1Q5T3J3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIF1Q5T3J3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIF1Q5T3J3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIF1Q5T3J3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIF1Q5T3J3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIF1Q5T3J3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIF1Q5T3J3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIF1Q5T3J3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIF1Q5T3J3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIF1Q5T3J3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIF1Q5T3J3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIF1Q5T3J3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIF1Q5T3J3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIF1Q5T3J3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIF1Q5T3J3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIF1Q5T3J3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIF1Q5T3J3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIF1Q5T3J3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIF1Q5T3J3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms