Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD4BQ5PRF9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms