Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SAMD9Q5K651 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
SAMD9Q5K651 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SAMD9Q5K651 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SAMD9Q5K651 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SAMD9Q5K651 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SAMD9Q5K651 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SAMD9Q5K651 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SAMD9Q5K651 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SAMD9Q5K651 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SAMD9Q5K651 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SAMD9Q5K651 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
SAMD9Q5K651 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.7
SAMD9Q5K651 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
SAMD9Q5K651 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SAMD9Q5K651 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
SAMD9Q5K651 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
SAMD9Q5K651 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
SAMD9Q5K651 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
SAMD9Q5K651 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SAMD9Q5K651 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
SAMD9Q5K651 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
SAMD9Q5K651 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
SAMD9Q5K651 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
SAMD9Q5K651 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SAMD9Q5K651 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SAMD9Q5K651 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SAMD9Q5K651 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SAMD9Q5K651 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SAMD9Q5K651 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SAMD9Q5K651 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SAMD9Q5K651 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SAMD9Q5K651 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SAMD9Q5K651 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SAMD9Q5K651 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SAMD9Q5K651 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SAMD9Q5K651 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms