Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HABP4Q5JVS0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HABP4Q5JVS0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HABP4Q5JVS0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HABP4Q5JVS0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HABP4Q5JVS0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HABP4Q5JVS0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HABP4Q5JVS0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HABP4Q5JVS0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HABP4Q5JVS0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HABP4Q5JVS0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HABP4Q5JVS0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HABP4Q5JVS0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HABP4Q5JVS0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HABP4Q5JVS0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HABP4Q5JVS0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HABP4Q5JVS0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HABP4Q5JVS0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HABP4Q5JVS0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HABP4Q5JVS0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HABP4Q5JVS0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HABP4Q5JVS0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HABP4Q5JVS0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HABP4Q5JVS0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HABP4Q5JVS0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HABP4Q5JVS0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HABP4Q5JVS0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HABP4Q5JVS0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HABP4Q5JVS0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms