Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL12Q53G59 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL12Q53G59 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL12Q53G59 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms