Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RFTN2Q52LD8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms