Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0A6

MINDY4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY4Q4G0A6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MINDY4Q4G0A6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms