Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CERKLQ49MI3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CERKLQ49MI3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CERKLQ49MI3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CERKLQ49MI3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CERKLQ49MI3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CERKLQ49MI3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CERKLQ49MI3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CERKLQ49MI3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CERKLQ49MI3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CERKLQ49MI3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CERKLQ49MI3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CERKLQ49MI3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CERKLQ49MI3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CERKLQ49MI3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CERKLQ49MI3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CERKLQ49MI3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CERKLQ49MI3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CERKLQ49MI3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CERKLQ49MI3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CERKLQ49MI3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CERKLQ49MI3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CERKLQ49MI3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CERKLQ49MI3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CERKLQ49MI3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms