Protein–RNA interactions for Protein: Q49AR2

C5orf22, UPF0489 protein C5orf22, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf22Q49AR2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C5orf22Q49AR2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C5orf22Q49AR2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
C5orf22Q49AR2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C5orf22Q49AR2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf22Q49AR2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf22Q49AR2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf22Q49AR2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf22Q49AR2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf22Q49AR2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C5orf22Q49AR2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C5orf22Q49AR2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C5orf22Q49AR2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C5orf22Q49AR2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C5orf22Q49AR2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms