Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RNF212Q495C1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RNF212Q495C1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms