Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-BQ31612 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-BQ31612 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-BQ31612 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-BQ31612 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-BQ31612 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-BQ31612 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-BQ31612 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-BQ31612 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-BQ31612 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-BQ31612 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-BQ31612 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-BQ31612 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-BQ31612 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms