Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNAPC1Q16533 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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