Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNXAQ16473 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms