Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK4Q16099 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK4Q16099 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK4Q16099 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIK4Q16099 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIK4Q16099 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIK4Q16099 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIK4Q16099 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIK4Q16099 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIK4Q16099 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK4Q16099 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK4Q16099 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK4Q16099 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK4Q16099 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK4Q16099 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK4Q16099 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK4Q16099 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK4Q16099 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK4Q16099 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
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