Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
VPS72Q15906 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
VPS72Q15906 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
VPS72Q15906 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
VPS72Q15906 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
VPS72Q15906 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
VPS72Q15906 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
VPS72Q15906 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
VPS72Q15906 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
VPS72Q15906 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
VPS72Q15906 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
VPS72Q15906 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.92■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
VPS72Q15906 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
VPS72Q15906 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
VPS72Q15906 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
VPS72Q15906 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
VPS72Q15906 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
VPS72Q15906 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
VPS72Q15906 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
VPS72Q15906 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
VPS72Q15906 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
VPS72Q15906 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
VPS72Q15906 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
VPS72Q15906 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
VPS72Q15906 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
VPS72Q15906 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
VPS72Q15906 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
VPS72Q15906 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC31.79■■■□□ 2.68
VPS72Q15906 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
VPS72Q15906 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
VPS72Q15906 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
VPS72Q15906 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
VPS72Q15906 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
VPS72Q15906 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
VPS72Q15906 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
VPS72Q15906 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
VPS72Q15906 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
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