Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHRNA2Q15822 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHRNA2Q15822 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHRNA2Q15822 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHRNA2Q15822 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHRNA2Q15822 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHRNA2Q15822 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CHRNA2Q15822 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHRNA2Q15822 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHRNA2Q15822 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHRNA2Q15822 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHRNA2Q15822 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHRNA2Q15822 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHRNA2Q15822 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHRNA2Q15822 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHRNA2Q15822 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHRNA2Q15822 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHRNA2Q15822 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHRNA2Q15822 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHRNA2Q15822 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHRNA2Q15822 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHRNA2Q15822 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHRNA2Q15822 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
CHRNA2Q15822 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHRNA2Q15822 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CHRNA2Q15822 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CHRNA2Q15822 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CHRNA2Q15822 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CHRNA2Q15822 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CHRNA2Q15822 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CHRNA2Q15822 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CHRNA2Q15822 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CHRNA2Q15822 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CHRNA2Q15822 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CHRNA2Q15822 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CHRNA2Q15822 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CHRNA2Q15822 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CHRNA2Q15822 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CHRNA2Q15822 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CHRNA2Q15822 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CHRNA2Q15822 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CHRNA2Q15822 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CHRNA2Q15822 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CHRNA2Q15822 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CHRNA2Q15822 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CHRNA2Q15822 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CHRNA2Q15822 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms