Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCN1Q15293 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCN1Q15293 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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