Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCF4Q15080 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCF4Q15080 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCF4Q15080 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms