Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NCAPD2Q15021 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NCAPD2Q15021 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NCAPD2Q15021 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NCAPD2Q15021 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NCAPD2Q15021 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NCAPD2Q15021 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NCAPD2Q15021 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NCAPD2Q15021 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NCAPD2Q15021 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NCAPD2Q15021 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NCAPD2Q15021 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NCAPD2Q15021 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NCAPD2Q15021 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NCAPD2Q15021 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NCAPD2Q15021 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NCAPD2Q15021 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NCAPD2Q15021 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NCAPD2Q15021 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NCAPD2Q15021 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NCAPD2Q15021 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NCAPD2Q15021 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NCAPD2Q15021 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
NCAPD2Q15021 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NCAPD2Q15021 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
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