Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CHD4Q14839 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHD4Q14839 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CHD4Q14839 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms