Protein–RNA interactions for Protein: Q14680

MELK, Maternal embryonic leucine zipper kinase, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MELKQ14680 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MELKQ14680 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MELKQ14680 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MELKQ14680 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MELKQ14680 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MELKQ14680 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MELKQ14680 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MELKQ14680 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MELKQ14680 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MELKQ14680 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MELKQ14680 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MELKQ14680 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MELKQ14680 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MELKQ14680 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MELKQ14680 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MELKQ14680 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MELKQ14680 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MELKQ14680 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MELKQ14680 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MELKQ14680 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MELKQ14680 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MELKQ14680 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MELKQ14680 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MELKQ14680 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MELKQ14680 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MELKQ14680 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MELKQ14680 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MELKQ14680 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MELKQ14680 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MELKQ14680 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MELKQ14680 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MELKQ14680 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MELKQ14680 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MELKQ14680 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MELKQ14680 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MELKQ14680 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MELKQ14680 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MELKQ14680 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MELKQ14680 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MELKQ14680 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MELKQ14680 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MELKQ14680 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MELKQ14680 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MELKQ14680 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MELKQ14680 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MELKQ14680 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MELKQ14680 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MELKQ14680 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MELKQ14680 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MELKQ14680 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MELKQ14680 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MELKQ14680 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MELKQ14680 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MELKQ14680 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MELKQ14680 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MELKQ14680 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MELKQ14680 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MELKQ14680 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MELKQ14680 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MELKQ14680 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MELKQ14680 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MELKQ14680 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MELKQ14680 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MELKQ14680 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MELKQ14680 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MELKQ14680 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MELKQ14680 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MELKQ14680 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MELKQ14680 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MELKQ14680 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MELKQ14680 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MELKQ14680 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MELKQ14680 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MELKQ14680 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MELKQ14680 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MELKQ14680 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MELKQ14680 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MELKQ14680 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MELKQ14680 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MELKQ14680 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MELKQ14680 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MELKQ14680 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MELKQ14680 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MELKQ14680 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MELKQ14680 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MELKQ14680 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MELKQ14680 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MELKQ14680 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MELKQ14680 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MELKQ14680 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MELKQ14680 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MELKQ14680 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MELKQ14680 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MELKQ14680 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MELKQ14680 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MELKQ14680 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MELKQ14680 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MELKQ14680 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MELKQ14680 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MELKQ14680 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms