Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.083e-7■■■□□ 18.5
PUM1Q14671 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.223e-7■■■□□ 18.5
PUM1Q14671 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.957e-7■■■□□ 18.5
PUM1Q14671 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.837e-7■■■□□ 18.5
PUM1Q14671 TMEM259-205ENST00000586704 2538 ntTSL 517.02■□□□□ 0.317e-7■■■□□ 18.5
PUM1Q14671 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.438e-7■■■□□ 18.5
PUM1Q14671 EIF4G1-233ENST00000475721 1271 ntTSL 220.92■□□□□ 0.947e-7■■■□□ 18.5
PUM1Q14671 EIF4G1-230ENST00000460829 1804 ntTSL 218.66■□□□□ 0.587e-7■■■□□ 18.5
PUM1Q14671 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.592e-6■■■□□ 18.5
PUM1Q14671 ACTB-205ENST00000432588 568 ntTSL 417.44■□□□□ 0.385e-11■■■□□ 18.4
PUM1Q14671 UBAP2-206ENST00000412543 1349 ntTSL 58.95□□□□□ -0.983e-7■■■□□ 18.4
PUM1Q14671 UBAP2-212ENST00000629575 3460 ntTSL 27.58□□□□□ -1.23e-7■■■□□ 18.4
PUM1Q14671 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.263e-7■■■□□ 18.4
PUM1Q14671 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.273e-7■■■□□ 18.4
PUM1Q14671 UBAP2-207ENST00000421278 833 ntTSL 55.42□□□□□ -1.543e-7■■■□□ 18.4
PUM1Q14671 PHF14-214ENST00000521747 2479 ntTSL 221.74■■□□□ 1.076e-7■■■□□ 18.4
PUM1Q14671 PHF14-202ENST00000423760 2627 ntTSL 220.64■□□□□ 0.896e-7■■■□□ 18.4
PUM1Q14671 PHF14-206ENST00000476009 1044 ntTSL 319.43■□□□□ 0.76e-7■■■□□ 18.4
PUM1Q14671 PHF14-210ENST00000490957 4058 ntTSL 514.5□□□□□ -0.096e-7■■■□□ 18.4
PUM1Q14671 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.136e-7■■■□□ 18.4
PUM1Q14671 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.276e-7■■■□□ 18.4
PUM1Q14671 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.183e-9■■■□□ 18.4
PUM1Q14671 AP3D1-203ENST00000585652 4433 ntTSL 212.35□□□□□ -0.433e-12■■■□□ 18.3
PUM1Q14671 AP3D1-206ENST00000589223 3357 ntTSL 211.42□□□□□ -0.583e-12■■■□□ 18.3
PUM1Q14671 ZNF598-206ENST00000564824 2147 ntTSL 524.05■■□□□ 1.443e-6■■■□□ 18.3
PUM1Q14671 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.282e-6■■■□□ 18.3
PUM1Q14671 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.163e-8■■■□□ 18.3
PUM1Q14671 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.143e-8■■■□□ 18.3
PUM1Q14671 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.13e-8■■■□□ 18.3
PUM1Q14671 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.033e-8■■■□□ 18.3
PUM1Q14671 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.313e-8■■■□□ 18.3
PUM1Q14671 MIER1-203ENST00000357692 4978 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.583e-8■■■□□ 18.3
PUM1Q14671 MIER1-207ENST00000371018 3875 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.623e-8■■■□□ 18.3
PUM1Q14671 MIER1-201ENST00000355356 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.093e-8■■■□□ 18.3
PUM1Q14671 EGFL7-206ENST00000492002 654 ntTSL 525.18■■□□□ 1.624e-7■■■□□ 18.3
PUM1Q14671 SRRM1-205ENST00000462710 2624 ntTSL 510.28□□□□□ -0.767e-11■■■□□ 18.3
PUM1Q14671 SRRM1-217ENST00000490543 673 ntTSL 510.11□□□□□ -0.797e-11■■■□□ 18.3
PUM1Q14671 TNNT1-214ENST00000589745 529 ntTSL 215.78■□□□□ 0.121e-10■■■□□ 18.3
PUM1Q14671 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.215e-15■■■□□ 18.2
PUM1Q14671 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.21e-7■■■□□ 18.1
PUM1Q14671 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.291e-7■■■□□ 18.1
PUM1Q14671 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.291e-7■■■□□ 18.1
PUM1Q14671 GTF2I-218ENST00000620879 4352 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.541e-7■■■□□ 18.1
PUM1Q14671 CCPG1-201ENST00000310958 6822 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.693e-7■■■□□ 18.1
PUM1Q14671 CCPG1-204ENST00000563171 790 ntTSL 58.44□□□□□ -1.063e-7■■■□□ 18.1
PUM1Q14671 CCPG1-212ENST00000569205 2970 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.13e-7■■■□□ 18.1
PUM1Q14671 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.243e-7■■■□□ 18.1
PUM1Q14671 CCPG1-211ENST00000568808 2866 ntTSL 1 (best)6.66□□□□□ -1.343e-7■■■□□ 18.1
PUM1Q14671 CCPG1-213ENST00000570272 570 ntTSL 46.51□□□□□ -1.373e-7■■■□□ 18.1
PUM1Q14671 CCPG1-208ENST00000568372 3388 ntTSL 1 (best)5.7□□□□□ -1.53e-7■■■□□ 18.1
PUM1Q14671 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.643e-7■■■□□ 18.1
PUM1Q14671 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.913e-7■■■□□ 18.1
PUM1Q14671 TNNT1-206ENST00000586649 340 ntTSL 59.05□□□□□ -0.961e-11■■■□□ 18.1
PUM1Q14671 BNIP3-204ENST00000633835 1062 ntTSL 322.39■■□□□ 1.177e-7■■■□□ 18.1
PUM1Q14671 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.197e-7■■■□□ 18.1
PUM1Q14671 BNIP3-202ENST00000540159 3066 ntTSL 1 (best)13.03□□□□□ -0.327e-7■■■□□ 18.1
PUM1Q14671 SERPINH1-211ENST00000529643 660 ntTSL 321.17■□□□□ 0.983e-6■■■□□ 18
PUM1Q14671 SERPINH1-209ENST00000528760 773 ntTSL 218.4■□□□□ 0.543e-6■■■□□ 18
PUM1Q14671 SERPINH1-210ENST00000528990 587 ntTSL 318.1■□□□□ 0.493e-6■■■□□ 18
PUM1Q14671 SEMA4C-203ENST00000449330 839 ntTSL 315.26■□□□□ 0.031e-6■■■□□ 18
PUM1Q14671 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.273e-6■■■□□ 18
PUM1Q14671 POLG-213ENST00000631044 4668 ntTSL 512.71□□□□□ -0.373e-6■■■□□ 18
PUM1Q14671 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.393e-6■■■□□ 18
PUM1Q14671 SERPINH1-203ENST00000525492 529 ntTSL 412.48□□□□□ -0.413e-6■■■□□ 18
PUM1Q14671 POLG-217ENST00000636774 4151 ntTSL 511.99□□□□□ -0.493e-6■■■□□ 18
PUM1Q14671 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.683e-7■■■□□ 18
PUM1Q14671 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.513e-7■■■□□ 18
PUM1Q14671 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.363e-7■■■□□ 18
PUM1Q14671 HK1-205ENST00000436817 1042 ntTSL 515.52■□□□□ 0.082e-7■■■□□ 18
PUM1Q14671 HK1-216ENST00000493591 916 ntTSL 56.17□□□□□ -1.422e-7■■■□□ 18
PUM1Q14671 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.312e-6■■■□□ 18
PUM1Q14671 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.112e-6■■■□□ 18
PUM1Q14671 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.062e-6■■■□□ 18
PUM1Q14671 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.772e-6■■■□□ 18
PUM1Q14671 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.18e-7■■■□□ 18
PUM1Q14671 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.173e-10■■■□□ 18
PUM1Q14671 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.12e-6■■■□□ 18
PUM1Q14671 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.093e-10■■■□□ 18
PUM1Q14671 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.053e-10■■■□□ 18
PUM1Q14671 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.013e-10■■■□□ 18
PUM1Q14671 STRN4-219ENST00000600615 788 ntTSL 212.98□□□□□ -0.333e-6■■■□□ 18
PUM1Q14671 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.984e-7■■■□□ 17.9
PUM1Q14671 RAN-208ENST00000537745 1065 ntTSL 1 (best)11.98□□□□□ -0.497e-7■■■□□ 17.9
PUM1Q14671 PRPF8-214ENST00000576585 2157 ntTSL 212.88□□□□□ -0.353e-8■■■□□ 17.9
PUM1Q14671 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.051e-7■■■□□ 17.9
PUM1Q14671 SMAP2-202ENST00000372718 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)16.99■□□□□ 0.311e-6■■■□□ 17.9
PUM1Q14671 ARID1A-204ENST00000430799 6521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.712e-9■■■□□ 17.9
PUM1Q14671 RBM25-211ENST00000532483 1052 ntTSL 55.78□□□□□ -1.486e-8■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 TSPYL2-203ENST00000553557 2607 ntTSL 213.72□□□□□ -0.212e-7■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 TOP2B-203ENST00000424225 3525 ntTSL 1 (best)12.39□□□□□ -0.436e-7■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.431e-7■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.555e-7■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 EHBP1-204ENST00000405482 1311 ntTSL 223.38■■□□□ 1.337e-8■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.053e-6■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.037e-8■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 EHBP1L1-205ENST00000529099 490 ntTSL 521.23■□□□□ 0.993e-6■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 PRMT1-218ENST00000534280 766 ntTSL 320.11■□□□□ 0.817e-8■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.87e-8■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 LRCH4-204ENST00000476881 1675 ntTSL 219.81■□□□□ 0.767e-8■■■□□ 17.8
PUM1Q14671 LRCH4-205ENST00000485554 774 ntTSL 319.3■□□□□ 0.687e-8■■■□□ 17.8
Retrieved 100 of 12,080 protein–RNA pairs in 75.8 ms