Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL4A6Q14031 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL4A6Q14031 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL4A6Q14031 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
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