Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGA9Q13797 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA9Q13797 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA9Q13797 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
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