Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOFQ13790 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOFQ13790 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOFQ13790 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOFQ13790 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APOFQ13790 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOFQ13790 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOFQ13790 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOFQ13790 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOFQ13790 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOFQ13790 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOFQ13790 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOFQ13790 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOFQ13790 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOFQ13790 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOFQ13790 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOFQ13790 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOFQ13790 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOFQ13790 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOFQ13790 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOFQ13790 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOFQ13790 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APOFQ13790 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOFQ13790 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOFQ13790 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOFQ13790 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOFQ13790 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOFQ13790 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOFQ13790 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOFQ13790 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOFQ13790 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOFQ13790 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOFQ13790 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APOFQ13790 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOFQ13790 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOFQ13790 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOFQ13790 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOFQ13790 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOFQ13790 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOFQ13790 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOFQ13790 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOFQ13790 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOFQ13790 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOFQ13790 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOFQ13790 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOFQ13790 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOFQ13790 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOFQ13790 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOFQ13790 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOFQ13790 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOFQ13790 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APOFQ13790 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOFQ13790 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOFQ13790 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOFQ13790 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APOFQ13790 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOFQ13790 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOFQ13790 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOFQ13790 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOFQ13790 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOFQ13790 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOFQ13790 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOFQ13790 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOFQ13790 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOFQ13790 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOFQ13790 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOFQ13790 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOFQ13790 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOFQ13790 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOFQ13790 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOFQ13790 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOFQ13790 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOFQ13790 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APOFQ13790 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOFQ13790 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOFQ13790 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOFQ13790 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOFQ13790 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOFQ13790 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOFQ13790 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOFQ13790 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOFQ13790 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOFQ13790 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOFQ13790 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOFQ13790 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOFQ13790 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOFQ13790 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOFQ13790 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOFQ13790 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOFQ13790 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOFQ13790 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOFQ13790 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOFQ13790 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APOFQ13790 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOFQ13790 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOFQ13790 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOFQ13790 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOFQ13790 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOFQ13790 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOFQ13790 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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