Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPBGQ13641 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPBGQ13641 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPBGQ13641 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPBGQ13641 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPBGQ13641 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPBGQ13641 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPBGQ13641 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPBGQ13641 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPBGQ13641 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPBGQ13641 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPBGQ13641 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPBGQ13641 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPBGQ13641 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPBGQ13641 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TPBGQ13641 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPBGQ13641 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPBGQ13641 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPBGQ13641 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
TPBGQ13641 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
TPBGQ13641 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TPBGQ13641 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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