Protein–RNA interactions for Protein: Q13571

LAPTM5, Lysosomal-associated transmembrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM5Q13571 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAPTM5Q13571 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAPTM5Q13571 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAPTM5Q13571 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms