Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB3Q13509 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB3Q13509 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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