Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SQSTM1Q13501 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SQSTM1Q13501 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SQSTM1Q13501 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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