Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TCIRG1Q13488 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms