Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXE3Q13461 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXE3Q13461 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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