Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
AP3B2Q13367 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
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