Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRSQ13332 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRSQ13332 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRSQ13332 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRSQ13332 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRSQ13332 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRSQ13332 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRSQ13332 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRSQ13332 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRSQ13332 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRSQ13332 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRSQ13332 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
PTPRSQ13332 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
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PTPRSQ13332 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRSQ13332 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRSQ13332 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRSQ13332 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRSQ13332 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRSQ13332 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRSQ13332 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRSQ13332 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRSQ13332 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRSQ13332 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRSQ13332 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRSQ13332 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRSQ13332 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRSQ13332 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRSQ13332 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRSQ13332 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
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