Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF6Q13247 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRSF6Q13247 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF6Q13247 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF6Q13247 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
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