Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBX3Q13185 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CBX3Q13185 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
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