Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPFIA1Q13136 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA1Q13136 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PPFIA1Q13136 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA1Q13136 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
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