Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAA1Q13131 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAA1Q13131 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAA1Q13131 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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