Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

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Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RLFQ13129 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RLFQ13129 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RLFQ13129 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RLFQ13129 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RLFQ13129 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RLFQ13129 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RLFQ13129 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RLFQ13129 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RLFQ13129 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RLFQ13129 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RLFQ13129 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RLFQ13129 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RLFQ13129 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RLFQ13129 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RLFQ13129 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RLFQ13129 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RLFQ13129 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RLFQ13129 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RLFQ13129 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RLFQ13129 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RLFQ13129 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RLFQ13129 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RLFQ13129 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RLFQ13129 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RLFQ13129 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RLFQ13129 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
RLFQ13129 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RLFQ13129 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RLFQ13129 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RLFQ13129 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RLFQ13129 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RLFQ13129 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RLFQ13129 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RLFQ13129 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RLFQ13129 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RLFQ13129 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RLFQ13129 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RLFQ13129 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RLFQ13129 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RLFQ13129 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RLFQ13129 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RLFQ13129 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RLFQ13129 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RLFQ13129 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RLFQ13129 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RLFQ13129 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RLFQ13129 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RLFQ13129 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RLFQ13129 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RLFQ13129 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RLFQ13129 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RLFQ13129 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RLFQ13129 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RLFQ13129 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RLFQ13129 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RLFQ13129 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RLFQ13129 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RLFQ13129 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RLFQ13129 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RLFQ13129 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RLFQ13129 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RLFQ13129 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RLFQ13129 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RLFQ13129 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RLFQ13129 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RLFQ13129 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RLFQ13129 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RLFQ13129 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RLFQ13129 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RLFQ13129 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RLFQ13129 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RLFQ13129 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RLFQ13129 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RLFQ13129 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RLFQ13129 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RLFQ13129 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RLFQ13129 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RLFQ13129 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RLFQ13129 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RLFQ13129 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RLFQ13129 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RLFQ13129 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RLFQ13129 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RLFQ13129 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RLFQ13129 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RLFQ13129 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RLFQ13129 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RLFQ13129 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RLFQ13129 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RLFQ13129 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RLFQ13129 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RLFQ13129 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RLFQ13129 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RLFQ13129 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
RLFQ13129 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RLFQ13129 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RLFQ13129 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RLFQ13129 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RLFQ13129 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
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