Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPS1Q13098 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPS1Q13098 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
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