Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STX4Q12846 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX4Q12846 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX4Q12846 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX4Q12846 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX4Q12846 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX4Q12846 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX4Q12846 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX4Q12846 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX4Q12846 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX4Q12846 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX4Q12846 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX4Q12846 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX4Q12846 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX4Q12846 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX4Q12846 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX4Q12846 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX4Q12846 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX4Q12846 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX4Q12846 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX4Q12846 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX4Q12846 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX4Q12846 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX4Q12846 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX4Q12846 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX4Q12846 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX4Q12846 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX4Q12846 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX4Q12846 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX4Q12846 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX4Q12846 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX4Q12846 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX4Q12846 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX4Q12846 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX4Q12846 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX4Q12846 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX4Q12846 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX4Q12846 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX4Q12846 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX4Q12846 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX4Q12846 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
STX4Q12846 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STX4Q12846 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STX4Q12846 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STX4Q12846 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX4Q12846 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX4Q12846 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX4Q12846 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX4Q12846 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX4Q12846 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX4Q12846 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX4Q12846 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX4Q12846 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX4Q12846 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX4Q12846 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX4Q12846 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX4Q12846 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX4Q12846 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX4Q12846 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX4Q12846 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX4Q12846 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX4Q12846 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX4Q12846 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX4Q12846 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX4Q12846 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX4Q12846 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX4Q12846 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX4Q12846 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX4Q12846 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX4Q12846 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX4Q12846 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX4Q12846 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX4Q12846 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX4Q12846 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX4Q12846 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX4Q12846 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX4Q12846 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX4Q12846 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX4Q12846 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX4Q12846 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX4Q12846 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX4Q12846 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX4Q12846 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX4Q12846 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX4Q12846 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX4Q12846 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX4Q12846 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX4Q12846 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
STX4Q12846 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX4Q12846 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX4Q12846 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
STX4Q12846 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX4Q12846 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX4Q12846 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX4Q12846 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX4Q12846 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX4Q12846 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX4Q12846 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX4Q12846 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STX4Q12846 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
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