Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.58■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF543Q08ER8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF543Q08ER8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms