Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CAMSAP2Q08AD1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CAMSAP2Q08AD1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CAMSAP2Q08AD1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CAMSAP2Q08AD1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CAMSAP2Q08AD1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CAMSAP2Q08AD1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CAMSAP2Q08AD1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CAMSAP2Q08AD1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CAMSAP2Q08AD1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CAMSAP2Q08AD1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CAMSAP2Q08AD1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CAMSAP2Q08AD1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CAMSAP2Q08AD1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CAMSAP2Q08AD1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CAMSAP2Q08AD1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CAMSAP2Q08AD1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CAMSAP2Q08AD1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CAMSAP2Q08AD1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CAMSAP2Q08AD1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
CAMSAP2Q08AD1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CAMSAP2Q08AD1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CAMSAP2Q08AD1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CAMSAP2Q08AD1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CAMSAP2Q08AD1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CAMSAP2Q08AD1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CAMSAP2Q08AD1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CAMSAP2Q08AD1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CAMSAP2Q08AD1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
CAMSAP2Q08AD1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CAMSAP2Q08AD1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CAMSAP2Q08AD1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CAMSAP2Q08AD1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CAMSAP2Q08AD1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CAMSAP2Q08AD1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CAMSAP2Q08AD1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CAMSAP2Q08AD1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CAMSAP2Q08AD1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CAMSAP2Q08AD1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CAMSAP2Q08AD1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CAMSAP2Q08AD1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CAMSAP2Q08AD1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
CAMSAP2Q08AD1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CAMSAP2Q08AD1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CAMSAP2Q08AD1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CAMSAP2Q08AD1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CAMSAP2Q08AD1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms